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《黄帝内经》的书名冠以黄帝，但作者并非轩辕黄帝。黄帝本是我国历史上原始社会末期生活在中原一带的民族之一，与“神农氏”并称为汉民族始祖。由于神农、黄帝两个民族对华夏文化形成有着深远影响，所以作为炎黄子孙的汉民族，往往把祖先的一些发明创造、典章制度等假讬于黄帝之名。

据现代一些学者研究，认为《黄帝内经》一书，并不是一个人所作，而是一部起始于战国，完成于西汉的跨时代集体之作。从现存的《黄帝内经》可以看出，除后人的部分增补外（例如唐代王冰对《素问》的增补），其内容有许多学术观点不一和自相矛盾之处。从书中所引用的《奇垣五中》《阴阳从容》《揆度》《明堂》《上经》《下经》等久已失传的古代医经著作来看，它的写作时代又很久远。所以《黄帝内经》应当是我国古代医家对秦、汉以前各医学家之医学理论的结论彙编，而假以黄帝之名，来提高其学术地位。